После поражения республики в 1939 году Самаранч изучал торговлю в бизнес-школе IESE (IESE Business School) в Барселоне. Сделал короткую карьеру как спортивный журналист в газете «Ла Пренса», которая завершилась его увольнением в 1943 году за критику в адрес сторонников футбольного клуба «Реал Мадрид» после победы со счётом 11-1 в игре с «Барселоной». После этого вернулся в текстильный бизнес своей семьи. Он стал членом совета директоров la Caixa, крупнейшего сберегательного банка Испании, в 1984 году и занимал пост президента с 1987 по 1999 год. Он остался почетным президентом и после своей отставки в 1999 году, до своей смерти.
Самаранч работал в муниципальном правительстве Барселоны, был ответственным за спорт, начиная с 1955 по 1962 год. Являлся прокурадором — членом нижней палаты парламента в течение последнего десятилетия режима Франко, с 1967 до восстановления демократии в 1977 году.
1955—1962 годы — советник по спорту муниципального совета Барселоны.
Неоднократно возглавлял испанскую делегацию на всевозможных событиях, связанных с олимпийским движением, и был назначен на должность председателя Олимпийского комитета Испании диктаторомФрансиско Франко в 1966 году. В том же году Самаранч стал членом МОК.
В 1967 году — национальный делегат по физическому воспитанию и спорту.
С 1973 года — председатель Провинциального совета Барселоны.
С 1974 по 1978 годы занимает пост вице-президента МОК.
С 1977 по 1980 годы занимает пост Чрезвычайного и Полномочного Посла Испании в СССР и Монголии.
За вклад в олимпийское движение король Испании в 1991 году присвоил Самаранчу титул маркиза (дона).
16 июля 2001 года избран почётным пожизненным президентом МОК.
20 апреля 2010 года Самаранч был доставлен в госпиталь Барселоны с диагнозом острой сердечной недостаточности. 21 апреля он скончался. Похоронен на Монжуикском кладбище в Барселоне.
Во время своего правления Самаранч сумел сделать олимпийское движение финансово самостоятельным, организовав спонсорство мероприятий и договорные телевизионные трансляции, приносящие большие суммы в бюджет МОК. Невзирая на бойкотлетних Олимпийских игр 1984 года Советским Союзом и странами Восточного блока, число стран-участниц Олимпийских игр постоянно росло от мероприятия к мероприятию, также рос и уровень атлетов, состязавшихся в соревнованиях — за счёт повышения общего уровня и планок вхождения в число атлетов-представителей стран.
Правление Самаранча было безусловным спасением для МОК, практически погибшего финансово во время кризиса 1970-х годов, когда был даже момент, когда город-организатор игр (Денвер) отказался их принимать в 1976 году. До этого все финансовые траты в одиночку несла принимающая сторона — Олимпийский Комитет той страны, в которой проходили игры. Во многом, именно факт поисков финансовой поддержки и факт допуска к играм спортсменов-профессионалов послужил противникам Самаранча на руку, дав старт слухам об излишней коммерциализации Олимпийского движения и послуживший причиной обвинения его в коррупции.
Именно во время правления МОК Самаранчем было введено правило обращения к нему, как к председателю МОК, «Ваше Превосходительство». Также всегда Самаранча повсюду встречал и провожал лимузин с шофёром и ожидали президентские номера гостиниц в любом городе, где бы и когда бы он ни появился. Так, во время остановки президента в швейцарской Лозанне в год на его проживание тратилось приблизительно 500 000 долларов США.
В историю Олимпийского движения Хуан Антонио Самаранч вошёл как человек, возродивший начинавшее угасать олимпийское движение.
Критика и отзывы
В книге «КГБ играет в шахматы» (авторы Б. Гулько, В. Корчной, В. Попов, Ю. Фельштинский) утверждается, что Самаранч был завербован в качестве агента КГБ и оказывал всемерную поддержку СССР; в книге утверждается, что завербованному Самаранчу голосами СССР и других социалистических стран была обещана должность президента МОК.
Орден Дружбы народов (Россия, 14 июля1994 года) — за большой вклад в развитие и укрепление международного олимпийского движения, повышения его роли в борьбе за мир между народами
Орден «За выдающиеся заслуги» (Узбекистан, 29 августа1996 года) — за заслуги в развитии Олимпийского движения, укреплении межгосударственного сотрудничества, мира, дружбы и взаимопонимания между народами и поддержку спорта Узбекистана, выдающийся вклад в завоевании им своего места в международной арене
Орден «Манас» III степени (Кыргызстан, 8 ноября1999 года) — за большие заслуги в поддержке олимпийского движения в Кыргызской Республике и проведении III Центрально-Азиатских игр в гор. Бишкек
Орден Золотого руна (Грузия, 28 августа2000 года) — за особый личный вклад, внесённый в развитие международного олимпийского движения, укрепление мира и дружбы между народами, поддержку олимпийского и спортивного движения Грузии в международных организациях, оказание помощи грузинским олимпийцам и ветеранам олимпийского движения, популяризацию олимпийских идей
↑"The Order of Sikatuna". Official Gazette of the Republic of the Philippines. Архивировано из оригинала 25 августа 2019. Дата обращения: 4 ноября 2023.
Волкова Г. И.Samaranch, Juan Antonio // Учебный испанско-русский лингвострановедческий словарь-справочник. — М.: Высш. шк., 2006. — С. 517. — 656 с. — ISBN 5-06-004248-0.