A Liga de Campións da UEFA 1998–99 foi a edición número 44 da máxima competición europea de fútbol a nivel de clubs organizada pola UEFA. A fase de grupos comezou en setembro e rematou en decembro. Os cuartos de final foron en marzo, as semifinais en abril, e a final foi o 26 de maio de 1999. Na final enfrontáronse o Bayern Múnic e mailo Manchester United, que venceu por 2 gol a 1 no derradeiro minuto do tempo engadido.
O mellor equipo de cada grupo acadou a clasificación para os cuartos de final da competición. As 2 prazas restantes foron para os 2 equipos con mellor puntuación dos 6 que remataron segundos: