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Nella genetica mitocondriale umana il macro-aplogruppo M (aplogruppo predominante nell'Eurasia orientale e nelle Americhe e parente del macro-aplogruppo N da cui invece discendono quasi tutti gli aplogruppi dell'Eurasia occidentale e dell'Oceania e qualche aplogruppo asiatico ed amerindo) è l'aplogruppo ancestrale (probabilmente l'aplogruppo M si originò contemporaneamente ad N 80.000/60.000 anni fa nell'Eurasia del sud) della maggior parte degli aplogruppi dell'India, Bangladesh, Siberia, America, Asia (dell'Est, Sud, Centro e Sud-est) e Melanesia. Da M derivano gli aplogruppi C, Z, D, E, G, Q e numerosi sottogruppi.
In Africa, si trova solo l'aplogruppo M1 (per l’aplogruppo N, in Africa, si trovano N1 e U6), più giovane sotto clade del macro aplogruppo M, presente però anche fuori dall'Africa (Asia occidentale, Caucaso e Asia centrale) mentre lì confinato quasi esclusivamente tra i popoli di lingua afro-asiatica. Per questo (come per il parente aplogruppo N diffuso invece in Eurasia occidentale) e per la diffusione di M in Asia (specie India e Asia Orientale), per le sue profonde radici asiatiche e per la totale varietà in questo continente, vien confermata la sua origine asiatica ed un'introgressione successiva in Africa (molto piccola). È coesistente inoltre con l'origine e la diffusione dell'aplogruppo F del cromosoma Y (l'Adamo euroasiatico) dal quale discende il 90/95% dell'attuale Homo sapiens sapiens fuori dall'Africa.
Si è stabilito un sistema per classificare filogeneticamente gli aplogruppi mitocondriali basato sulle lettere da A a Z come segue:
Aplogruppi mitocondriali umani | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Eva mitocondriale (L) | ||||||||||||||||||||||||||||||||
L0 | L1 | L2 | L3 | L4 | L5 | L6 | ||||||||||||||||||||||||||
M | N | |||||||||||||||||||||||||||||||
CZ | D | E | G | Q | A | I O | R | S | W | X | Y | |||||||||||||||||||||
C | Z | B | F | R0 | JT | P | U | |||||||||||||||||||||||||
HV | J | T | K | |||||||||||||||||||||||||||||
H | V |